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先了解病人再对症下药·基因组学带动医药科学

报道:关丽玲 / 摄影:林毅钲
 
12月初,有一项令亚洲生物科学家振奋的好消息──国际联盟“GenomeAsia 100K计划(GenomeAsia 100K Project)”的亚洲人基因组分析研究成果登上了权威学术杂志《自然(Nature)》封面。
 
这项具有代表性的研究报告涵盖亚洲多国包括大马人种的基因组分析。马大基因学及分子生物副教授陈国银博士通过马大的高影响力研究单位参与了这项研究计划,他向本报分享此研究的目的,从中可以看到生物基础科学的重要性和影响力。
 
分析亚洲人基因·助发展个人化用药
亚洲人基因组分析研究一共分析了来自64个国家1739人的基因组(印度598人、马来西亚156人、韩国152人、巴基斯坦113人、蒙古100人、中国70人、巴布亚纽几内亚70人、印尼68人、菲律宾52人、日本35人、俄罗斯32人),基于涵盖最多的亚洲区域和人种,意义重大。 “GenomeAsia 100K计划”的目标是达到10万名亚洲人的基因组。
 
全世界有百分之四十的人口来自亚洲,但却只有百分之六的基因组记录。这项研究之所以重要,陈国银解释是因为了解不同人种的基因组,有助于在医疗和个人化用药的发展。
“所有的尖端研究都集中在欧美,亚洲人占世界人口这么多,可是亚洲人种的研究却比较少,因此这项研究恰恰填补了亚洲人基因组的空缺。”
 
陈国银提到,现在的医疗技术和药物都是针对欧美人而研发出来,有了亚洲人基因组,就可以更准确地对症下药。
 
马大基因学及分子生物副教授陈国银博士:科学研究已经踏入大数据时代,可以迅速及大量地应付各种资料,加速科研进展。
 
提高治疗准确性
收集及分析基因组属于基础科学,接下来就是应用科学的发挥。 “为什么某些人种的糖尿病特别高,或者容易患癌,是因为基因,还是后天的不良生活习惯导致?还有了解癌细胞的演变、癌症的进程,施药是要杀死癌细胞、阻碍癌细胞繁殖、阻碍疾病的演变,这都需要基础研究去发掘。”
 
陈国银以Free Size的T恤比喻现有的医疗和药物治疗,并不是适合所有人。一旦掌握人种基因组的特征,可能可找出相同的药物治疗,为什么有些人复原得很快,有些人则有副作用,这是基因问题对药物产生的反应,可成为下一步准确性的治疗。
 
亚洲应重视基础科学
陈国银点出基础科学的重要,亚洲地区一向不重视基础科学,人们会在乎学了是否有用。欧美国家的决策者则很注重基础科学,他们知道没有基础科学,就不会有应用科学,如工程、医学、药剂等等。
 
医学、工程、药剂一直是理科毕业生的职业生涯选项,很少会考虑念生物、化学和数学。陈国银劝勉学生,若对基础科学有兴趣,不必太担心前途,总会找到自己的舞台。
从事科学研究的人,当解决一个科学题目,有了发现,会有动力持续做下去,成就感和满足感就是这样来的。
 
陈国银同时间做着不同的案子,他说这是研究员的喜好,他喜欢这样因为不会沉闷,也认同因没那么快看到研究成果,不同研究项目同时进行既充满挑战性,但也非常充实。
 
科研需耐得住寂寞
科研的路,是一条长远的路,这是他常对博士新生说的话。 “你走的是一条长远的路,可能没有人鼓掌,要受得了才好。”通常他这么一说,吓走了一大半学生。 “我不想他们一开始就走错,或者有错误的科学观念,走剩的一半才是真正喜欢这行业的。”
 
也是大马科学院院士的陈国银强调,发表论文是研究生最重要的任务,过程艰难,但意义重大。他记得导师说过,大学教授、科学院士跟其他教育工作者唯一的分别就是发表论文,在期刊跟世人分享学术成果,科研继续做下去,人类才进步。
 
国际联盟“GenomeAsia 100K计划(GenomeAsia 100K Project)”的亚洲人基因组分析研究成果登上了权威学术杂志《自然(Nature)》封面。
 
马大高影响力研究单位·三代测序加速分析数据
除了马大,国大也在较早的阶段,负责大马人基因组的收集资料工作,而马大则负责分析数据的部分,陈国银透露,若没有马大的高影响力研究单位(High Impact Research , HIR),就会错失参与这项具代表性研究的机会。在HIR的支持下,马大增加了第三代测序(Next Generation Sequencing, NGS)设备,让研究人员可以快速地分析基因组数据。
 
陈国银2006年从英国修完基因工程及分子微生物博士学位回来后,在马大研究细菌学和组学,这也是他目前的著重的研究。 “以前,在还没有基因组学的时候,分析一个基因,可能会花上半个月至半年的时间,没有效率。当时,觉得这过程太慢,后来拿到英国首相研究基金,回到英国做研究,接触到基因组学,我发现这就是生物学的未来。”
 
2009年回马之后,陈国银积极去找研究基因组的资料和仪器,但处处碰钉,不是没听过就是不了解,以为要用回老方法。一直到HIR的成立,他受委为HIR项目协调员,就向校方提出基因组研究是可行的方向,之后马大HIR就有了三代测序的高科技研究设备。
 
“当年,只有中国和日本有类似科技,用第三代测序去做这项研究,真的快很多,现在不用8天的时间就可以完成数年的研究。在2014年,HIR已经具备了亚太区最完美的三代测序。
 
加入亚洲人基因组100K
“由于HIR发展得不错,吸引了外国学者到来,其中包括人类基因组学研究,亚洲100K就是其中一个,当时是跟国大开始的,原本只是小规模,研究大马人口各种肤色的人种,是基因还是后天造成的,只想用三代测序去找出一个小问题而已,后来则有机会加入亚洲人基因组100K国际联盟。”
 
陈国银表示,10年前基因组学的发展不太顺利,是因为三代测序还没成熟,虽然已知道基因组学,碍于工具而无法做到,这种瓶颈在科学发展很正常。有了三代测序后,基因组研究顿时起飞,刚好HIR成立,从第一代用到现在第三代。现在,亚洲的三代测序发展不比欧美差。
 
陈国银希望,透过这样的基础研究,可以带动下一代的医药科学,从中研发新的治疗方法,这也是先进国家研究的方向。 “研究药物固然重要,但就算出了再多的新药,不了解病人则无法达到效果,先了解病人再对症下药才是正确的方案。”
 
这种属于人类基因组的大数据,使用高端电脑去化验和分析,改变了一般人对生物学的印象,以为生物学就只是解剖青蛙等实验。科学研究已经踏入大数据时代,可以迅速及大量地应付各种资料,加速科研进展。
 
除了科学研究,HIR也支持其他社会科学、人文类研究。目前,HIR的任务已告一段落,但所建立下的精神和设备仍然对后来的研究有很大的帮助。

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